1.A【解析】国家下达“抗生素使用限令”是为了避免抗生素对细菌变异的选择,导致细菌抗药性基因频率提高,最终使细菌朝抗药性增强的方向进化,A错误;家畜的驯化采用了人工选择育种的方式,这种育种方式一般是在经过突变和基因重组产生生物变异的基础上进行的,B正确;Ti质粒的T-DNA片段整合到受体细胞的染色体DNA上,属于基因重组,是生物进化的原材料,C正确;自然选择通过作用于具有不同表型的个体,使种群的基因频率发生定向改变,进而使生物朝着适应环境的方向进化,具有有利变异的个体数量会不断增加,D正确。